Analiza transcriptomică spațială la nivel de celulă unică a anatomiei pielii umane

Pielea este cel mai mare organ uman și o zonă cu o încărcătură semnificativă de boli, însă organizarea sa celulară și moleculară în întregul corp este în mare parte nedefinită. Potrivit nature.com, aici construim un atlas spațial la nivel de celulă unică la scară organicală din aproximativ 1,2 milioane de celule din pielea umană normală de adult, rezolvând locația a 45 de tipuri de celule din 114 mostre ce cuprind 15 site-uri anatomice.

👉 Compoziția celulară și organizația vecinătăților multicelulare în pielea umană

Descoperim o compoziție stereotipică de tipuri de celule specifică site-urilor și organizarea acestora în zece vecinătăți multicelulare, cea mai notabilă fiind o vecinătate perivasculară ce amintește de țesutul limfoid asociat pielii. În cadrul acestei vecinătăți, analizele ligand-receptor (L–R) identifică un rol central al factorului de necroză tumorală în menținerea fibroblastelor perivasculare CCL19+, evidențiind interacțiunile homeostatice între imunitate și stroma.

În final, comparând dinamica vecinătății în transcriptomica spațială a bolilor de piele, constatăm modificări imune în toate bolile în această vecinătate perivasculară, sugerând compartimentarea spațială a activității patogene. Astfel, vecinătățile multicelulare stau la baza organizării moleculare și macroanatomice a pielii la multiple scale, orchestrană interacțiunile celulare și specializarea site-urilor anatomice, precum și prezentând o perturbare arhitecturală în caz de boală.